1 вересня 1993 року в смт.Межова за адресою: вул..Сонячна 8 було відкрито Межівську середню загальноосвітню школу № 3, яку споруджено в цьому ж році.
1 вересня 1993 року педагогічний колектив очолив
Директор школи
Столярова Любов Федорівна
Заступник директора з навчально-виховної роботи
Омеляненко Раїса Василівна
Заступник директора з виховної роботи
Закопко Тетяна Миколаївна
Навчали учнів щирі й доброзичливі педагоги, кваліфіковані спеціалісти:
Вчителі укр. мови та літератури
Ляшенко Ганна Василівна,
Ляшенко Ніна Павлівна
Вчитель зарубіжної літератури та російської мови
Гужва Людмила Михайлівна
Вчителі іноземної мови
Гриценко Вікторія Данилівна,
Самотуга Андрій Валерійович
Вчитель математики
Шаулко Ніна Василівна
Вчитель інформатики
Шаулко Іван Михайлович
Вчитель історії та правознавства
Кошарна Тетяна Олексіївна
Вчитель біології
Іванченко Тетяна Іванівна
Вчитель географії
Мелешко Тетяна Олександрівна
Вчитель фізики
Кубрак Світлана Леонідівна
Вчитель хімії
Черненко Ірина Миколаївна
Вчителі трудового навчання
Риб’янець Геннадій Олександрович,
Яцура Людмила Олександрівна
Вчитель фізичної культури
Токар Сергій Олександрович,
Куц Олег Вадимович
Вчителі музики
Гнатенко Олена Василівна,
Довженко Лілія Вікторівна
Вихователь групи продовженого дня
Кривко Світлана Іванівна
Вітали першокласників їхні перші вчителі:
Вчителі початкових класів:
Кривонос Ніла Олександрівна,
Іванисенко Валентина Григорівна,
Панфілова Ганна Іванівна,
Лисенко Ніна Герасимівна,
Бакаляр Раїса Дмитрівна,
Угнівенко Ольга Миколаївна
В квітні 2002 року з метою реалізації завдань з питань модернізації вітчизняної системи освіти, конкретних вимог по виконанню Національної доктрини розвитку освіти України відділ освіти Межівської райдержадміністрації порушив клопотання про реорганізацію Межівської середньої загальноосвітньої школи № 3 в Межівський аграрний ліцей-інтернат. Заклад нового типу повинен був забезпечити цільову підготовку сільської молоді до вступу у вищі навчальні заклади, дати змогу організувати безперервну освіту – середня загальноосвітня школа – вищий навчальний заклад.
03.04.2002 року управління освіти і науки облдержадміністрації дає згоду на реорганізацію Межівської СЗШ № 3 в заклад нового типу «Межівський аграрний ліцей-інтернат»
16 квітня 2002 року рішенням першої сесії 24 скликання Межівська районна рада Дніпропетровської області приймає рішення про реорганізацію Межівської СШ № 3 в аграрний ліцей-інтернат. На черговій сесії районної ради було затверджено Статут аграрного ліцею-інтернату та погоджено призначення керівника закладу освіти.
27 06.2002 року Макаренко Лідію Григорівну було призначено директором районного комунального закладу освіти Межівський аграрний ліцей-інтернат з 27.07.2002 року. Наказом по відділу освіти Межівської райдержадміністрації № 31 від 27.06.2002 директором призначено Макаренко Лідію Григорівну з 01.07.2002 року.
У серпні 2002 року між Дніпропетровським державним аграрним університетом та колективом МАЛІ було підписано договір про співробітництво. Сторони зобов’язувались: ДДАУ надавати допомогу в навчально-методичній, науковій та виховній діяльності ліцею-інтернату, а саме: здійснювати викладання профільних дисциплін, спецкурсів та факультативів в ліцеї-інтернаті. А колектив МАЛІ – надавати можливість факультетам агро університету проводити навчально-дослідницьку роботу на території ліцею-інтернату.
В закладі сформовано 8 класів із загальною кількістю 181 учень .Крім того, на базі учнів 1-4 класів було створено Межівську початкову школу (директор Свистун Лариса Леонідівна)
1 вересня 2012 року директором районного комунального закладу освіти Межівський аграрний ліцей-інтернат призначено Зарудняк Олену Олексіївну.